Thèse : Rôle des traits racinaires sur l'acquisition de nutriments via la mycorhize

Retour à la liste des résultats

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Les plantes présentent diverses stratégies d'acquisition des ressources du sol, allant de l'absorption directe par les racines à des stratégies collaboratives où la plante s'appuie sur des partenaires fongiques. Les champignons mycorhiziens établissent une symbiose avec la plupart des espèces végétales et améliorent leur acquisition de nutriments en accédant à de grands volumes de sol grâce à leurs réseaux d'hyphes. L'acquisition directe de nutriments par les racines et l'absorption par les champignons mycorhiziens à arbuscules (CMA) constituent toutes deux un investissement en carbone pour la plante. Si les racines peuvent acquérir des nutriments de manière indépendante, ce processus nécessite l'allocation de carbone pour maintenir la croissance et les fonctions racinaires. De même, les plantes fournissent du carbone pour maintenir la collaboration avec les CMA. Malgré des preuves croissantes que les caractéristiques ou traits du système racinaire d'une plante influencent les stratégies d'acquisition de nutriments, on connait peu de choses sur la manière dont la variation intraspécifique de ces traits influence la nutrition en azote et en phosphore via la mycorhize. 

L'objectif de ce projet de doctorat est de caractériser le rôle des traits racinaires et des communautés de CMA sur la régulation de la nutrition mycorhizienne chez le blé.

 Les deux principaux objectifs de la thèse seront (i) de déterminer l’effet de la variation intraspécifique des traits racinaires du blé pour l'établissement et le fonctionnement de la symbiose mycorhizienne; et (ii) d'évaluer l’effet de la variation intraspécifique des traits racinaires et des besoins nutritionnels du blé sur l'assemblage des communautés mycorhiziennes. Pour cela, vous réaliserez principalement des expériences en conditions contrôlées. Vous mesurerez l’expression de gènes marqueurs de la colonisation et de la nutrition mycorhizienne par qRT-PCR, et les échanges trophiques entre plantes et CMA par traçage avec des isotopes stables. Vous caractériserez les communautés mycorhiziennes par séquençage à haut débit d’un amplicon PCR. Ce projet apportera de nouvelles connaissances sur l'importance des traits racinaires, non seulement sur l'absorption directe, mais aussi sur les interactions symbiotiques, essentielles à la résilience et à la durabilité des systèmes de culture. Ces résultats auront des applications concrètes dans la sélection de variétés de blé adaptées aux systèmes de culture à faibles intrants, où l'optimisation de la coopération mycorhizienne pourrait réduire la dépendance aux engrais chimiques.

Vous serez basé-e au Laboratoire d'Interactions Plantes-Microbes-Environnement (LIPME, équipe « Efficacité de la symbiose mycorhizienne à arbuscules », https://www.lipme.fr/efis ; Castanet-Tolosan). 

Formations et compétences recherchées

Formation en sciences végétales, en agronomie ou en écologie. 

Une expérience en écologie du système plante-sol, en interactions plantes-microorganismes, en travail de terrain et en analyse de données écologiques serait un plus. 

Vous devrez être en capacité de travailler de manière autonome et collaborative. 

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Pour postuler, veuillez envoyer votre lettre de motivation et votre CV en un seul fichier au format PDF à agnes.ardanuy@inrae.fr et benoit.lefebvre@inrae.fr avec [PhD_traits_NOM] comme objet.

Les candidatures seront examinées à partir du 16 septembre.
Les candidats présélectionnés seront convoqués à un entretien la semaine du 22 septembre.