Ingénieur-e données agronomiques

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

L’URGI, unité INRAE de recherche en bioinformatique dédiée à la génomique et à la génétique des plantes, recherche un ingénieur en données agronomiques, en contrat CDD pour 12 mois renouvelable. La personne recrutée intégrera le service « Système d’information et intégration de données », comprenant dix ingénieurs bio informaticien et suivant des méthodologies agiles.

Missions

La personne recrutée participera au développement du système d’information de l’URGI, à la gestion des données et à leur intégration en vue d'analyse. Ses activités seront principalement au service du projet AGENT¹ et dans une moindre mesure de PHENET² et de la communauté ELIXIR³. Le projet AGENT vise à rendre disponibles les données FAIR (Findable Accessible Interoperable and Reusable) de diversité génétique du blé et de l’orge. Le projet PHENET développe des outils, des méthodes et des services de phénotypage et de l'envirotypage. La mission de la personne recrutée sera de faire le pont entre la biologie végétale et la science de la gestion des données à travers 3 activités : (i) l'évolution des standards de données de phénotypage (MIAPPE, BrAPI, ICASA) et l'élaboration de guidelines et de formations pour les partenaires, (ii) l'intégration et l'analyse des données en utilisant les technologies modernes (base de données graphe, LLM, IA) et (iii) les évolutions des outils de gestion et curation de données basés sur FAIRDOM/Seek.

Formations et compétences recherchées

Compétences nécessaires

* Bonnes capacités relationnelles, goût pour le travail en équipe.

* Connaissances de bases en agronomie, biologie végétale, expérimentation végétale, ... D'une façon générale, curiosité pour la nature des données scientifiques.

* Capacités rédactionnelles.

* Maîtrise de l’anglais technique du domaine pour dialoguer avec les partenaires.

* Maîtrise de l’environnement Linux.

* Notion de développement informatique.

Compétences optionnelles (Formation durant le contrat)

* Modélisation de données, ontologies et web sémantique.

* Outils de gestion de version (git)

* Langages de script (bash, python, Jupyter, R, …)

* Connaissance en analyse de données agronomiques

* Notions en grand modèle de langage et intelligence artificielle

Formation

Master2 / Ecole d’ingénieur (Agronomie, data science, ...).

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation