Influence du pH gastrique sur la digestion in vitro gastro-intestinale de particules d’aliments solides par des approches innovantes en imagerie par résonance magnétique (IRM)

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Les aliments solides arrivent dans l'estomac sous forme de particules de 0 à 5 mm de diamètre. En fonction de leurs propriétés structurelles et compositionnelles, la digestion de ces particules peut être limitée par la diffusion des enzymes digestives en leur sein, la résistance de microstructures aux attaques enzymatiques (ex : gluten, parois cellulaires), ou encore par des conditions de pH défavorables à l'activité des enzymes (par effet tampon). Par sa capacité à caractériser, de manière non invasive et non destructive, la composition et structure des aliments à différentes échelles (de la molécule à la particule), l'IRM est une méthode de choix pour suivre les cinétiques de digestion et améliorer notre compréhension des mécanismes de déstructuration des particules d’aliments solides.

L'objectif de cette thèse est d'étudier les mécanismes limitant la déstructuration des particules d’aliments solides et la libération de leurs nutriments, au cours de digestions in vitro sous IRM. Un focus particulier sera fait sur l’impact de la cinétique d’acidification gastrique, connue pour être très variable d'un individu à l'autre (variabilité inter-individuelle ou induite par la prise d’inhibiteurs de pompe à protons), sur les cinétiques de digestion gastro-intestinales. L’'effet matrice de l’emmental, au fort effet tampon, sera d’abord étudié à l’aide de 2 dispositifs permettant d’étudier les phénomènes à l’échelle du mélange de particules d’une part, et d’une particule unique d’autre part. Dans un second temps, l’effet matrice de la pomme, prise comme modèle de fruit charnu, sera également étudié.

Les expériences seront réalisées sur l’appareil IRM 1.5 T (SOLA, Siemens) à l’aide des dispositifs originaux, et déjà validés, pour la conduite de digestions in vitro sous IRM. 

Le doctorant sera intégré aux collectifs des deux unités de recherche, OPAALE et STLO (distantes d’environ 2 km), au sein desquelles l’ensemble du matériel nécessaire à la thèse est disponible. La thèse sera co-encadrée par :

Directrice de thèse : Maja Musse, chercheuse INRAE, UR OPAALE, équipe IRM-Food

Co-directeur : Steven Le Feunteun, chercheur INRAE, UMR STLO, équipe BN   

Formations et compétences recherchées

Idéalement, le candidat sera un physicien ou un physico-chimiste possédant des connaissances de base sur la physique de l’IRM/RMN et le traitement du signal/des images. Des compétences ou un attrait pour des applications en sciences alimentaires, en nutrition et/ou en biologie seraient également appréciées. Un bon niveau d’anglais est également requis. 

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation