CONCOURS IE22-ALIMH-1

Bio-informaticien-ne

63122 ST GENES CHAMPANELLE

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Présentation d'INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la recherche. 

C'est un acteur majeur de la recherche et de l’innovation créé le 1er janvier 2020. Institut de recherche finalisé issu de la fusion entre l’Inra et Irstea, INRAE rassemble une communauté de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. 

L’institut se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal, et se classe 11ème mondial en écologie-environnement. Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Votre activité s'exercera au sein de l'Unité de Nutrition Humaine (INRAE, centre ARA Clermont Ferrand/Theix).
Vous assurerez une mission de proximité en bioinformatique et bioanalyse et serez amené-e à mettre vos compétences au service des équipes de l'unité utilisant les approches omics, mais dépourvues de ce type de compétences en interne (soit 4 équipes).
Les objectifs principaux des équipes avec lesquelles vous serez amené-e à travailler portent sur la compréhension des mécanismes de régulation des grandes fonctions physiologiques par la nutrition, aussi bien chez l'homme, que sur les modèles animaux et les cellules in vitro.
Vous interviendrez dans les différentes étapes des projets de recherche:
- Accompagner le chercheur en amont des projets pour toutes les questions concernant la bioinformatique et la bioanalyse et le plan de gestion de données (PGD)
- Interagir avec les prestataires de service le cas échéant, devis
- Collecter et stocker des données en accord avec le plan de gestion de données
- Interroger les banques de données disponibles en ligne
- Gérer le processus séquentiel de traitements des données générées
- Procéder à la programmation de processus informatiques permettant de répondre au mieux aux questions des utilisateurs
- Gérer les traitements statistiques de base
- Faire le lien entre les équipes de recherche et les plateformes "omics"
- Prendre en charge le contact avec les biostatisticiens dans le cas des projets les plus complexes.
En particulier des liens étroits seront mis en place avec les biostatisticiens de la plateforme d'exploration du métabolisme de l'UNH ainsi qu'avec le réseau des bioinformaticiens Clermontois (AuBi)
Un comité transversal sera mis en place et permettra de recenser régulièrement les besoins de chacune des équipes concernées. Il sera constitué à minima d'un représentant par équipe et pourra être ouvert à d'autres agents selon l'expertise nécessaire pour discuter des stratégies à développer en termes d'analyses. Ceci permettra de prioriser régulièrement et de façon consensuelle les projets sur lesquels vous serez sollicité-e. Vous assurerez une veille scientifique et technique en vue de l'amélioration des stratégies de traitements de données. Vous adapterez les applications bioinformatiques existantes aux besoins des projets.
Vous mettrez en place une démarche Qualité sur le savoir-faire technique spécifique du traitement et de l'exploitation des données pour les pérenniser, en faciliter la formation, et permettre leur valorisation.
Vous prendrez part à l'encadrement des étudiants et du personnel temporaire dans le traitement de leurs données et à la formation en interne des chercheurs.
Poste transversal rattaché directement au DU.

Formations et compétences recherchées

Licence, Maîtrise, Master 1

Informatique appliquée, programmation.
Utiliser un ensemble cohérent d'outils mathématiques, statistiques et informatiques adaptés au traitement et à l'analyse des données.
Mettre en oeuvre les techniques de recueil, de stockage, d'analyse et de traitement des données.
Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats.
Connaissance approfondie et critique des différents types de protocoles expérimentaux conduisant à la génération de données omics. Connaissance générale dans le domaine des sciences de la vie lié aux études.
Concevoir un plan d'échantillonnage.
Capacité à s'intégrer, à communiquer et à interagir dans un environnement de biologistes.
Autonomie, organisation, dynamisme, rigueur et motivation.
Mettre en oeuvre une démarche qualité.
Concevoir des outils pédagogiques.
Transférer son savoir-faire en interne et externe
Master Bio-informatique, programmation perl, R, Galaxy

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez :

- de 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formationconseil en orientation professionnelle ;
d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Référence de l'offre

  • N° profil : IE22-ALIMH-1
  • Corps : IE
  • Catégorie : A
  • Emploi-type : A2A41
    Référentiel des emplois types
  • Numéro du concours : IEA01

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